Nano-Microbiology / Yoojin Oh

- Gruberstrasse 40, Raum 431, 4. Stock
0732 2468 7644
Yoo_jin.oh(at)jku.at

Curriculum Vitae

2004 – 2009
2000 – 2004
PhD in Physics (Condensed Matter Physics), Department of Physics, College of Natural Science, Ewha Womans University, Seoul, Korea.	BSc. in Department of Physics, College of Natural Science, Ewha Womans University, Seoul, Korea

2004 – 2009

2000 – 2004

PhD in Physics (Condensed Matter Physics), Department of Physics, College of Natural Science, Ewha Womans University, Seoul, Korea.

BSc. in Department of Physics, College of Natural Science,

Ewha Womans University, Seoul, Korea

2004 – 2009

PhD in Physics (Condensed Matter Physics), Department of Physics, College of Natural Science, Ewha Womans University, Seoul, Korea.

2000 – 2004

BSc. in Department of Physics, College of Natural Science,

Ewha Womans University, Seoul, Korea

08/2018 – present
03/2017 - present
Project Leader (Group leader) Elise-Richter Fellow, Institute of Biophysics, JKU Linz, Austria	Lecturer, Johannes Kepler University Linz, Austria

08/2018 – present

03/2017 - present

Project Leader (Group leader)

Elise-Richter Fellow, Institute of Biophysics, JKU Linz, Austria

Lecturer, Johannes Kepler University Linz, Austria

08/2018 – present

Project Leader (Group leader)

Elise-Richter Fellow, Institute of Biophysics, JKU Linz, Austria

03/2017 - present

Lecturer, Johannes Kepler University Linz, Austria

05/2017 – 08/2018
05/2014 – 04/2017
R&D Engineer, EISGSIS, Keysight Technologies GmbH, Austria	Project Leader, APART Fellow (Austrian Programme for Advanced Research and Technology, Austrian Academy of Sciences), Institute of Biophysics, JKU Linz, Austria
08/2013 – 04/2014
R&D Engineer, EISGSIS, Keysight Technologies GmbH, Austria	Post-doc, Institute of Biophysics, JKU Linz, Austria
08/2011 – 07/2013
R&D Engineer, EISGSIS, Keysight Technologies GmbH, Austria	Marie-Curie Fellow, IIF fellowship, FP7, EU Host institute: Institute of Biophysics, JKU Linz, Austria
05/2010 – 07/2011
R&D Engineer, EISGSIS, Keysight Technologies GmbH, Austria	Post-doc, Institute of Biophysics, JKU Linz, Austria
10/2009 – 04/2010
R&D Engineer, EISGSIS, Keysight Technologies GmbH, Austria	R&D Engineer & Training in CD-Lab (industrial partner Agilent Technologies GmbH), Institute of Biophysics, JKU Linz, Austria

05/2017 – 08/2018	R&D Engineer, EISGSIS, Keysight Technologies GmbH, Austria
05/2014 – 04/2017	Project Leader, APART Fellow (Austrian Programme for Advanced Research and Technology, Austrian Academy of Sciences), Institute of Biophysics, JKU Linz, Austria
08/2013 – 04/2014	Post-doc, Institute of Biophysics, JKU Linz, Austria
08/2011 – 07/2013	Marie-Curie Fellow, IIF fellowship, FP7, EU Host institute: Institute of Biophysics, JKU Linz, Austria
05/2010 – 07/2011	Post-doc, Institute of Biophysics, JKU Linz, Austria
10/2009 – 04/2010	R&D Engineer & Training in CD-Lab (industrial partner Agilent Technologies GmbH), Institute of Biophysics, JKU Linz, Austria

Selected Talks at International Conferences

06/2021
12/2020
Invited talk, 17^th International Workshop on Nanomechanical Sensing (NMC2021), Calgary, Canada	Lecture series, NABIAM, University of South Bohemia, Czech Republic
02/2019
Invited talk, 17^th International Workshop on Nanomechanical Sensing (NMC2021), Calgary, Canada	Lab Seminary, College of Engineering, Sungkyunkwan University, Suwon, Korea
11/2017
Invited talk, 17^th International Workshop on Nanomechanical Sensing (NMC2021), Calgary, Canada	Seminar, Unite de Chimi des Interfaces, Universite Catholique de Louvain, Louvain-la-Neuve, Belgium
07/2017
Invited talk, 17^th International Workshop on Nanomechanical Sensing (NMC2021), Calgary, Canada	Invited talk, EKC (European-Korean Conference), Stockholm, Sweden
06/2017
Invited talk, 17^th International Workshop on Nanomechanical Sensing (NMC2021), Calgary, Canada	SHAMROK Seminar, Department of Physics, University of Sheffield, UK
06/2014
Invited talk, 17^th International Workshop on Nanomechanical Sensing (NMC2021), Calgary, Canada	Invited talk, International Scanning Probe Microscopy Conference, Seoul, Korea
05/2014
Invited talk, 17^th International Workshop on Nanomechanical Sensing (NMC2021), Calgary, Canada	University Colloquia, University Clinic of Dentistry Vienna, Vienna, Austria

11/2011
Invited talk, 17^th International Workshop on Nanomechanical Sensing (NMC2021), Calgary, Canada	Keynote Address, Microscopy Society of Southern Africa Annual Conference, Pretoria

02/2010
Invited talk, 17^th International Workshop on Nanomechanical Sensing (NMC2021), Calgary, Canada	Lab Seminary, Oak Ridge National Lab., Tennessee, USA

08/2009
Invited talk, 17^th International Workshop on Nanomechanical Sensing (NMC2021), Calgary, Canada	Lab Seminary, Department of Physics, University of Leeds, Leeds, UK

06/2021	Invited talk, 17^th International Workshop on Nanomechanical Sensing (NMC2021), Calgary, Canada
12/2020	Lecture series, NABIAM, University of South Bohemia, Czech Republic
02/2019	Lab Seminary, College of Engineering, Sungkyunkwan University, Suwon, Korea
11/2017	Seminar, Unite de Chimi des Interfaces, Universite Catholique de Louvain, Louvain-la-Neuve, Belgium
07/2017	Invited talk, EKC (European-Korean Conference), Stockholm, Sweden
06/2017	SHAMROK Seminar, Department of Physics, University of Sheffield, UK
06/2014	Invited talk, International Scanning Probe Microscopy Conference, Seoul, Korea
05/2014	University Colloquia, University Clinic of Dentistry Vienna, Vienna, Austria
11/2011	Keynote Address, Microscopy Society of Southern Africa Annual Conference, Pretoria
02/2010	Lab Seminary, Oak Ridge National Lab., Tennessee, USA
08/2009	Lab Seminary, Department of Physics, University of Leeds, Leeds, UK

Orcid ID

Research Interests

Our research focuses on nano-metric properties of bio-materials (proteins, bacteria, biofilm, pathogens, materials for bio-applications) that require the application of a whole portfolio of nanoscopic and microscopic. Particularly, we have investigated pathogenic systems with single molecule biophysics methods to establish interdisciplinary medically-oriented research, by incorporating biophysics, physics, microscopy, engineering, and microbiology. Our main interest of research is to understand the detailed molecular mechanisms underlying bacterial interaction and the development of biofilm pathogenicity.

Methods

Atomic fore microscopy (AFM)
Single molecule force spectroscopy (SMFS)
Surface plasmon resonance (SPR)

Team


Name
Lisa Hain
Position	PhD student
E-Mail	lisa.hain@jku.at
Karin Albrecht
Position	Bachelor student
E-Mail


Name	Position	E-Mail
Lisa Hain	PhD student	lisa.hain@jku.at
Karin Albrecht	Bachelor student

Students supervision

Funding

2020-2023
2018-2023
DOC-program (Molecular Interactions of European Lyme Disease Spirochetes probed by AFM, L. Hain), Austrian Academy of Sciences (OEAW). Mentor	Elise-Richter Programm (SPM studies on single cellular interactions with biofilm), FWF. PI
2017-2022
DOC-program (Molecular Interactions of European Lyme Disease Spirochetes probed by AFM, L. Hain), Austrian Academy of Sciences (OEAW). Mentor	Joint Research Project South Korea-Austria (Quantification of DNA and protein biomarkers without amplification using AFM), FWF. Co-PI
2019-2021
DOC-program (Molecular Interactions of European Lyme Disease Spirochetes probed by AFM, L. Hain), Austrian Academy of Sciences (OEAW). Mentor	Scientific & Technological Cooperation with Czech Republic (Role of adhesins in formation of Borrelia burgdorferi biofilm-like structures), OEAD. PI
2018-2021
DOC-program (Molecular Interactions of European Lyme Disease Spirochetes probed by AFM, L. Hain), Austrian Academy of Sciences (OEAW). Mentor	Scientific & Technological Cooperation with India (Single molecule biophysics using a small amplitude atomic force microscopy), OEAD. PI
2017-2018
DOC-program (Molecular Interactions of European Lyme Disease Spirochetes probed by AFM, L. Hain), Austrian Academy of Sciences (OEAW). Mentor	Scientific & Technological Cooperation with Czech Republic (Deciphering the molecular interactions involved in the pathogenesis of European Lyme Disease spirochete), OEAD. Co-PI
2014-2017
DOC-program (Molecular Interactions of European Lyme Disease Spirochetes probed by AFM, L. Hain), Austrian Academy of Sciences (OEAW). Mentor	Austrian Programme for Advanced Research and Technology [APART] (Nanoscopic studies of single molecular fimbril adhesion and recognition) Austrian Academy of Sciences (OEAW). PI
2013
DOC-program (Molecular Interactions of European Lyme Disease Spirochetes probed by AFM, L. Hain), Austrian Academy of Sciences (OEAW). Mentor	AMISTEC GmbH, Austria (Influence of surface morphology on the antimicrobial effect of transition metal oxides in polymer surface), Co-PI
2011-2013
DOC-program (Molecular Interactions of European Lyme Disease Spirochetes probed by AFM, L. Hain), Austrian Academy of Sciences (OEAW). Mentor	Marie Curie Incoming Fellowship (Microbial recognition and adhesion on the nano scale using Bio-SPM), FP7, EU. PI
2011
DOC-program (Molecular Interactions of European Lyme Disease Spirochetes probed by AFM, L. Hain), Austrian Academy of Sciences (OEAW). Mentor	Instrument development for frequency modulation-AFM, City of Linz and Upper Austria Government. Co-PI

2020-2023	DOC-program (Molecular Interactions of European Lyme Disease Spirochetes probed by AFM, L. Hain), Austrian Academy of Sciences (OEAW). Mentor
2018-2023	Elise-Richter Programm (SPM studies on single cellular interactions with biofilm), FWF. PI
2017-2022	Joint Research Project South Korea-Austria (Quantification of DNA and protein biomarkers without amplification using AFM), FWF. Co-PI
2019-2021	Scientific & Technological Cooperation with Czech Republic (Role of adhesins in formation of Borrelia burgdorferi biofilm-like structures), OEAD. PI
2018-2021	Scientific & Technological Cooperation with India (Single molecule biophysics using a small amplitude atomic force microscopy), OEAD. PI
2017-2018	Scientific & Technological Cooperation with Czech Republic (Deciphering the molecular interactions involved in the pathogenesis of European Lyme Disease spirochete), OEAD. Co-PI
2014-2017	Austrian Programme for Advanced Research and Technology [APART] (Nanoscopic studies of single molecular fimbril adhesion and recognition) Austrian Academy of Sciences (OEAW). PI
2013	AMISTEC GmbH, Austria (Influence of surface morphology on the antimicrobial effect of transition metal oxides in polymer surface), Co-PI
2011-2013	Marie Curie Incoming Fellowship (Microbial recognition and adhesion on the nano scale using Bio-SPM), FP7, EU. PI
2011	Instrument development for frequency modulation-AFM, City of Linz and Upper Austria Government. Co-PI

Teaching

LVA Nr.	Titel	Anmeldung	Typ	SSt.	LeiterInnen	Rhythmus

Publications

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Ablauf	6 Monate
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_ga	Wird verwendet, um Benutzer zu unterscheiden.	2 Jahre	Google
_gid	Wird verwendet, um Benutzer zu unterscheiden und die Nutzung der Website zu analysieren. Es werden anonyme Daten zur Anzahl von Besuchern, die besuchten Seiten und die Quelle des Zugriffes erfasst.	1 Tag	Google
_gat_UA-112203476-1	Wird zum Drosseln der Anfragerate bei Google Analytics für Websites mit hohen Nutzerzahlen verwendet.	1 Minute	Google
__Secure-ENID	Wird in Zusammenhang mit Google-Diensten verwendet. Das Cookie dient primär der Sicherheit und Authentifizierung.	13 Monate	Google
AEC	Wird verwendet, um unbefugten Zugriff und Cross-Site-Request Forgery (CSRF) Angriffe zu verhindern.	6 Monate	Google
SOCS	Wird verwendet, um die Cookie-Einstellungen des Users zu speichern.	13 Monate	Google
_pk_id	Wird verwendet, um einige Details über den Benutzer zu speichern wie z.B. die eindeutige Besucher-ID.	13 Monate	JKU
_pk_ses	Kurzlebiges Cookie, welches verwendet wird, um Daten für den Besuch vorübergehend zu speichern.	30 Minuten	JKU
_pk_ref	Wird benutzt, um die Informationen der Herkunftswebsite des Benutzers zu speichern.	6 Monate	JKU

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Zweck	Wird verwendet, um Benutzer zu unterscheiden und die Nutzung der Website zu analysieren. Es werden anonyme Daten zur Anzahl von Besuchern, die besuchten Seiten und die Quelle des Zugriffes erfasst.
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Zweck	Wird verwendet, um zwischen User und Userverhalten zu unterscheiden.
Ablauf	3 Monate
Anbieter	Google
_gac_UA-112203476-1
Zweck	Enthält Kampagneninformationen und dient der Messung des Kampagnenerfolges von Google AdWords Kampagnen.
Ablauf	90 Tage
Anbieter	Google
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IDE
Zweck	Enthält eine zufallsgenerierte User-ID. Anhand dieser ID kann Google den User über verschiedene Websites domainübergreifend wiedererkennen und personalisierte Werbung ausspielen.
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Anbieter	Google
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Zweck	Dieses Cookie wird gesetzt, wenn ein User über einen Klick auf eine Google Werbeanzeige auf die Website gelangt. Es enthält Informationen darüber, welche Werbeanzeige geklickt wurde, sodass erzielte Erfolge wie z.B. Bestellungen oder Kontaktanfragen der Anzeige zugewiesen werden können.
Ablauf	3 Monate
Anbieter	Google
AMCV_xx
Zweck	Enthält eine zufallsgenerierte User-ID. Anhand dieser ID kann die Adobe Marketing Cloud den User über verschiedene Websites domainübergreifend wiedererkennen und personalisierte Werbung ausspielen.
Ablauf	3 Jahre
Anbieter	LinkedIn
bcookie
Zweck	Enthält eine ID des Browsers.
Ablauf	2 Jahre
Anbieter	LinkedIn
bscookie
Zweck	Enthält eine ID des Browsers bei einer sicheren Verbindung.
Ablauf	2 Jahre
Anbieter	LinkedIn
lang
Zweck	Wird verwendet, um die Spracheinstellung des Besuchers zu speichern.
Ablauf	Session
Anbieter	LinkedIn
lidc
Zweck	Wird verwendet, um Benutzer zu unterscheiden und die Nutzung der Website zu analysieren. Es werden anonyme Daten zur Anzahl von Besuchern, die besuchten Seiten und die Quelle des Zugriffes erfasst.
Ablauf	1 Tag
Anbieter	LinkedIn
lissc
Zweck	Wird für die Analyse der Nutzung von eingebetteten Dienstleistungen verwendet.
Ablauf	1 Jahr
Anbieter	LinkedIn
UserMatchHistory
Zweck	Enthält Kampagneninformationen und dient der Messung des Kampagnenerfolges.
Ablauf	30 Tage
Anbieter	LinkedIn
fr
Zweck	Enthält Kampagneninformationen und dient der Messung des Kampagnenerfolges.
Ablauf	90 Tage
Anbieter	Facebook
fbp
Zweck	Wird von Facebook genutzt, um eine Reihe von Werbeprodukten anzuzeigen, zum Beispiel Echtzeitangebote dritter Werbetreibender.
Ablauf	90 Tage
Anbieter	Facebook
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Zweck	Wird verwendet, um Benutzer über mehrere Domains hinweg zu unterscheiden.
Ablauf	1 Jahr
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sc-country
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Anbieter	Snap
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Zweck	Dieses Cookie enthält eine zufallsgenerierte User-ID und wird für das Ausspielen und die Echtzeitermittlung der Preise für Anzeigen für differenzierte Zielgruppen verwendet.
Ablauf	60 Tage
Anbieter	Adform
C
Zweck	Identifiziert und speichert ob Nutzer Cookies akzeptieren. Wert 1: Cookies sind erlaubt, Wert 3: Cookies sind nicht erlaubt.
Ablauf	30 Tage
Anbieter	Adform
_scid_r
Zweck	Wird verwendet, um User anhand einer eindeutigen ID zu identifizieren und maßgeschneiderte Werbung basierend auf den Useraktivitäten zu liefern. Es dient zur Optimierung von Werbeinhalten und Kampagnen.
Ablauf	13 Monate
Anbieter	Snapchat
_scid
Zweck	Wird verwendet, User anhand einer eindeutigen ID zu identifizieren und über verschiedene Websites hinweg zu verfolgen und gezielte Werbung basierend auf dem Userverhalten anzuzeigen.
Ablauf	13 Monate
Anbieter	Snapchat
X-AB
Zweck	Cookie steht in Zusammenhang mit Snapchat-Inhalten.
Ablauf	1 Tag
Anbieter	Snapchat
_ScCbts
Zweck	Wird verwendet, um Werbeanzeigen zu optimieren, Inhalte zu personalisieren, Sicherheitsmaßnahmen zu verbessern und die Nutzung zu analysieren.
Ablauf	7 Tage
Anbieter	Snapchat
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Zweck	Wird verwendet, um die Cookie-Einstellungen für User ohne LinkedIn Registrierung zu speichern.
Ablauf	6 Monate
Anbieter	LinkedIn

Name	Zweck	Ablauf	Anbieter
_ga	Wird verwendet, um Benutzer zu unterscheiden.	2 Jahre	Google
_gid	Wird verwendet, um Benutzer zu unterscheiden und die Nutzung der Website zu analysieren. Es werden anonyme Daten zur Anzahl von Besuchern, die besuchten Seiten und die Quelle des Zugriffes erfasst.	1 Tag	Google
_gcl_au	Wird verwendet, um zwischen User und Userverhalten zu unterscheiden.	3 Monate	Google
_gac_UA-112203476-1	Enthält Kampagneninformationen und dient der Messung des Kampagnenerfolges von Google AdWords Kampagnen.	90 Tage	Google
test_cookie	Wird testweise gesetzt, um zu prüfen, ob der Browser das Setzen von Cookies erlaubt. Enthält keine Identifikationsmerkmale.	15 Minuten	Google
IDE	Enthält eine zufallsgenerierte User-ID. Anhand dieser ID kann Google den User über verschiedene Websites domainübergreifend wiedererkennen und personalisierte Werbung ausspielen.	1 Jahr	Google
_gcl_aw	Dieses Cookie wird gesetzt, wenn ein User über einen Klick auf eine Google Werbeanzeige auf die Website gelangt. Es enthält Informationen darüber, welche Werbeanzeige geklickt wurde, sodass erzielte Erfolge wie z.B. Bestellungen oder Kontaktanfragen der Anzeige zugewiesen werden können.	3 Monate	Google
AMCV_xx	Enthält eine zufallsgenerierte User-ID. Anhand dieser ID kann die Adobe Marketing Cloud den User über verschiedene Websites domainübergreifend wiedererkennen und personalisierte Werbung ausspielen.	3 Jahre	LinkedIn
bcookie	Enthält eine ID des Browsers.	2 Jahre	LinkedIn
bscookie	Enthält eine ID des Browsers bei einer sicheren Verbindung.	2 Jahre	LinkedIn
lang	Wird verwendet, um die Spracheinstellung des Besuchers zu speichern.	Session	LinkedIn
lidc	Wird verwendet, um Benutzer zu unterscheiden und die Nutzung der Website zu analysieren. Es werden anonyme Daten zur Anzahl von Besuchern, die besuchten Seiten und die Quelle des Zugriffes erfasst.	1 Tag	LinkedIn
lissc	Wird für die Analyse der Nutzung von eingebetteten Dienstleistungen verwendet.	1 Jahr	LinkedIn
UserMatchHistory	Enthält Kampagneninformationen und dient der Messung des Kampagnenerfolges.	30 Tage	LinkedIn
fr	Enthält Kampagneninformationen und dient der Messung des Kampagnenerfolges.	90 Tage	Facebook
fbp	Wird von Facebook genutzt, um eine Reihe von Werbeprodukten anzuzeigen, zum Beispiel Echtzeitangebote dritter Werbetreibender.	90 Tage	Facebook
sc_at	Wird verwendet, um Benutzer über mehrere Domains hinweg zu unterscheiden.	1 Jahr	Snap
sc-country	Dieses Cookie unterscheidet das Land des Benutzers.	1 Tag	Snap
uid	Dieses Cookie enthält eine zufallsgenerierte User-ID und wird für das Ausspielen und die Echtzeitermittlung der Preise für Anzeigen für differenzierte Zielgruppen verwendet.	60 Tage	Adform
C	Identifiziert und speichert ob Nutzer Cookies akzeptieren. Wert 1: Cookies sind erlaubt, Wert 3: Cookies sind nicht erlaubt.	30 Tage	Adform
_scid_r	Wird verwendet, um User anhand einer eindeutigen ID zu identifizieren und maßgeschneiderte Werbung basierend auf den Useraktivitäten zu liefern. Es dient zur Optimierung von Werbeinhalten und Kampagnen.	13 Monate	Snapchat
_scid	Wird verwendet, User anhand einer eindeutigen ID zu identifizieren und über verschiedene Websites hinweg zu verfolgen und gezielte Werbung basierend auf dem Userverhalten anzuzeigen.	13 Monate	Snapchat
X-AB	Cookie steht in Zusammenhang mit Snapchat-Inhalten.	1 Tag	Snapchat
_ScCbts	Wird verwendet, um Werbeanzeigen zu optimieren, Inhalte zu personalisieren, Sicherheitsmaßnahmen zu verbessern und die Nutzung zu analysieren.	7 Tage	Snapchat
li_gc	Wird verwendet, um die Cookie-Einstellungen für User ohne LinkedIn Registrierung zu speichern.	6 Monate	LinkedIn

Nano-Microbiology / Yoojin Oh

Publikationen

Vorträge

Forschungsprojekte

Scientific Community Services

Erfindungen

Curriculum Vitae

Research Interests

Methods

Team

Funding

Teaching

Publications

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Vorträge

Forschungsprojekte

Scientific Community Services

Erfindungen

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Education

Current Position

Previous Positions

Scientific Talks

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Methods

Team

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